将大本营提高至15级后，才能解开运用运输船的建造权限，除了这些之后必须在拥有港口的城市建立海军基地作为运作中心。跨区域调动部队或物资时，需确保双方属于同一军团。在输入目标坐标后即可发起运输指令，这个经过中要注意不同海域的航行限制，避免因权限不足导致运输失败。

先将待运输的陆军单位移动到运输船停泊的港口附近，选中部队后点击运输船图标即可触发装载程序，也可通过海军基地的管理界面直接勾选需要登船的单位。要特别注意运输船的载重限制，仅支持步兵、摩托化步兵和轻型坦克等轻型单位。重型装甲部队需要通过军团唯一通道转运，超载不仅会降低航速，还也许导致运输途中出现故障。航线规划时要兼顾效率和安全双重影响，手动调整途径时应尽量绕开敌方海军的常规巡逻区域，优先选择夜间或恶劣天气时段出发以提高隐蔽性。长途运输前必须检查港口的燃油储备，航线中途可在友方港口补给，或者通过空军建立临时燃料点。提议组合驱逐舰或巡洋舰组成护卫编队，遭遇敌方拦截时让护航舰艇主动迎敌，运输船则立即执行规避航线加速撤离。抵达目标港口后点击卸货按钮即可完成部队部署，若目的地已被敌方占领，需要先用海军炮火压制岸防工事，再让登陆部队快速抢占港口周边的战略高地，避免陷入敌军的包围陷阱。

通过科技更新可以逐步提高运输船的载重量和航行速度，后期解开的防御装甲能有效降低被拦截时的损失。多艘运输船协同运作时可采用交替航行玩法，避免空船返程造成的资源浪费。日常保持3-5艘备用运输船的储备，能确保在紧急情况下快速运用。