在诸侯讨董这个剧本里新增了暴虐值的设定，暴虐值会影响多个方面，玩家需要尽量降低自己的暴虐值。每次增加暴虐值时，除了同盟势力之外的全部势力都会降低等值的好感度，这些势力的好感度越低，主动进攻自己势力的概率越大。另外在和其他势力战斗时，暴虐值也会影响双方的战力，其中暴虐值低的一方会获取战力加成。我方的暴虐值每比敌方低一点，战力就会提高百分之1，如果我方的暴虐值比敌方高，那么战力加成将被敌方获取。最后部分事件和成就也只在达到特定的暴虐值时会触发，如果暴虐值不够或者太高会让它们不会触发。

暴虐值的增减可以通过多种方式达成，最常见的是打下其他势力的治所。在其他剧本里，打下治所后可以得到钱粮、兵甲或者独特资源的奖励，然而在诸侯讨董里不会有这些奖励。而是要玩家处理打下治所的归属权，可以选择把它还给朝廷，也可以选择据为己有。如果把它还给朝廷的话会降低十点暴虐值，当暴虐值足够低时可以在朝廷势力里借道。把它据为己有的话会增加20暴虐值，同时也会让同盟外的势力都降低20好感度，此时好感太低的势力会主动对我方势力出兵。另外当我方治所被其他势力占领也会减少十点暴虐值。

在加入同盟后，解开盟内的特定谋攻卡也能改变我方的暴虐值。比如招募义兵这个谋攻卡被激活后，盟内全部势力在增加暴虐值时，都会让增加的量减少百分之5。会盟里的部分条约也能减少暴虐值，比如消弭暴虐被通过后，接下来一年里盟主的暴虐值会减少20点，参和会盟的民族也都会减少五点暴虐值。部分民族政策也会让暴虐值减少，比如西园印绶施行后我方的暴虐值会减少20点。

剧本里还增加了同盟方法，在诸侯讨董里会有多个同盟出现，玩家也可以同时加入多个同盟。然而部分同盟需要达成特定条件才能被建立，加入这些同盟也要满足它的标准。关东的诸侯势力在开局会自动进入酸枣同盟，玩家后面可以和其他势力建立聚义、合军和贵金三种通用同盟。选择刘协势力的话，在完成条件后还可以建立兴继皇图这个汉室唯一同盟。在建立通用联盟时需要对好感度顶尖的势力发出建盟邀请，这样同意的概率会大一些。